TABLE 1.
Primers used to generate ORF 1 clones of VR-2332
| Primer | Sequence | Location |
|---|---|---|
| 658P1/ | 5′-CAGGAGCTGTGACCATTGGC | 45–64 |
| /658P4 | 5′-GAAGGGTGTTTCTGTGCAGC | 60–79 |
| 5′5500/ | 5′-CAAGACCCAATTCTGCACG | 5848–5863 |
| 5′6050/ | 5′-GCGCCCCTCAGGCCAGTTTT | 6049–6068 |
| /3′5800 | 5′-TGGCTGCCGACCTTCAC | 6124–6140 |
| 5′5800/ | 5′-GGCAGCCACATAATTAAAGACATA | 6149–6172 |
| /3′6200 | 5′-ACTGCACCGAGGCTTGAA | 6458–6475 |
| LAF2/ | 5′-GCTTTGTATCTGCTTCAAACATG | 6544–6566 |
| 5′7550/ | 5′-GGTCCCCGTCAACCCAGAGAAT | 7522–7543 |
| /3′ORF1b | 5′-ACCGTCGACATTCATCATACCTA | 7568–7590 |
| /3′8242 | 5′-CGGATAATGGGACAGGTTC | 7633–7652 |
| /3′42-60 | 5′-AATCCTTTCACCCGCATCA | 8123–8141 |
| 5′40-56/ | 5′-CCTGATGCGGGTGAAAG | 8139–8156 |
| 5′8342/ | 5′-AGGAGMAYTGGCAAACYGTGAC | 8352–8375 |
| 5′8242/ | 5′-CCCGCYAAGACCTCKATGG | 8539–8560 |
| VRBP1/ | 5′-GTTTGGTGATCTATGCACAG | 9080–9099 |
| 5′-160/ | 5′-TCCCACCATGCCAAACTATCACTG | 9237–9260 |
| /VRBP2 | 5′-CAGATGTTCAACCCACCAGT | 9257–9277 |
| VRBP5/ | 5′-CTCATGGACAGCTGTGCTTG | 9463–9482 |
| /3′965 | 5′-GTGGGCCGATGATGAACCTG | 10028–10047 |
| VRBP9/ | 5′-GAATGCACGGTTGCTCAGGC | 10840–10859 |
| 5′1500/ | 5′-GAGGACGACGCCATCACTAT | 10588–10787 |
| /VRBP6 | 5′-CCCAGGAGTGCCTAGAAAC | 11163–11181 |
| /3′2260 | 5′-GGTGACATCCTCCAACGGTAGTGC | 11325–11348 |
| /VRBP4 | 5′-GTTCAATGACAGGGCCCGG | 12031–12049 |
| /P23 | 5′-GCCACCACATCCAAACTAC | 12489–12507 |