Table 6. Specificities of compounds identified as CK1 and DYRK inhibitors.
The concentrations of compounds used in the assays are indicated below each molecule and the results are presented as the percentage activity remaining in the presence of inhibitor as compared with control incubations with inhibitor omitted (averages of duplicate determinations). Each experiment was repeated two or three times with similar results. Further details of the assays are given in the Materials and methods section. Important values are highlighted in boldface type.
| Percentage activity remaining | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kinase | D4476 (10 μM) | CK1-7 (25 μM) | IC261 (25 μM) | Harmine (1 μM) | Harmane (1 μM) | Harmalol (1 μM) | Harmaline (1 μM) |
| MKK1 | 93±2 | 76±2 | 86±2 | 73±4 | 90±6 | 86±1 | 95±3 |
| ERK1 | 102±4 | 102±4 | 91±6 | 95±5 | 107±1 | 107±1 | 108±4 |
| ERK2 | 85±2 | 100±2 | 93±4 | 95±5 | 95±6 | 95±6 | 87±0 |
| JNK1 | 86±5 | 91±1 | 94±2 | 89±3 | 92±4 | 102±4 | 96±3 |
| JNK2 | 77±7 | 87±9 | 101±3 | 91±5 | 84±6 | 99±6 | 86±7 |
| JNK3 | 82±0 | 103±0 | 93±4 | 91±0 | 89±2 | 113±0 | 89±0 |
| p38α MAPK | 38±1 | 103±5 | 92±4 | 100±7 | 74±1 | 96±2 | 88±4 |
| p38β MAPK | 55±2 | 101±9 | 97±7 | 103±4 | 90±7 | 95±4 | 92±1 |
| p38γ MAPK | 87±1 | 102±3 | 93±4 | 80±3 | 97±9 | 104±2 | 120±6 |
| p38δ MAPK | 89±2 | 80±8 | 91±4 | 88±1 | 90±1 | 89±4 | 92±5 |
| ERK8 | 80±4 | 29±6 | 68±2 | 80±1 | 70±0 | 62±3 | 44±4 |
| RSK1 | 81±1 | 48±3 | 87±3 | 105±6 | 98±1 | 100±9 | 110±5 |
| RSK2 | 82±1 | 63±4 | 89±1 | 104±3 | 94±1 | 83±8 | 112±1 |
| PDK1 | 85±1 | 83±3 | 89±5 | 87±1 | 90±7 | 93±6 | 86±9 |
| PKBα | 107±9 | 54±1 | 94±5 | 101±7 | 104±3 | 89±2 | 95±0 |
| PKBβ | 88±1 | 89±4 | 90±3 | 90±1 | 91±8 | 81±1 | 105±1 |
| SGK1 | 73±2 | 25±2 | 79±4 | 83±1 | 86±4 | 86±3 | 85±7 |
| S6K1 | 76±5 | 49±5 | 84±2 | 93±3 | 94±3 | 94±8 | 93±1 |
| PKA | 85±6 | 65±7 | 82±3 | 80±9 | 95±2 | 90±4 | 89±1 |
| ROCK 2 | 105±1 | 65±6 | 78±0 | 80±4 | 104±1 | 91±8 | 79±6 |
| PRK2 | 107±4 | 47±3 | 87±5 | 86±4 | 85±6 | 86±3 | 85±1 |
| PKCα | 94±5 | 86±3 | 90±2 | 82±4 | 90±5 | 92±1 | 90±9 |
| PKCζ | 81±1 | 52±1 | 80±4 | 83±1 | 89±3 | 88±0 | 84±3 |
| PKD1 | 43±4 | 60±3 | 62±3 | 80±9 | 88±1 | 111±3 | 108±1 |
| MSK1 | 90±7 | 42±2 | 88±1 | 83±5 | 91±11 | 96±1 | 94±1 |
| MNK1 | 81±1 | 26±0 | 79±3 | 82±4 | 82±1 | 97±1 | 80±1 |
| MNK2 | 88±4 | 76±0 | 97±5 | 80±4 | 112±4 | 106±5 | 92±2 |
| MAPKAP-K2 | 99±4 | 85±3 | 88±4 | 110±4 | 109±3 | 88±1 | 89±4 |
| MAPKAP-K3 | 98±3 | 86±7 | 94±3 | 98±6 | 104±6 | 99±9 | 97±5 |
| PRAK | 77±2 | 81±4 | 82±5 | 90±2 | 84±8 | 85±3 | 74±1 |
| CaMKKα | 89±1 | 86±4 | 67±4 | 95±4 | 86±6 | 103±1 | 92±1 |
| CaMKKβ | 100±2 | 86±3 | 86±2 | 81±1 | 93±5 | 90±1 | 89±7 |
| CaMK1 | 88±2 | 82±3 | 55±5 | 94±4 | 91±4 | 101±3 | 103±0 |
| SmMLCK | 81±5 | 84±7 | 70±2 | 87±7 | 100±4 | 107±9 | 112±2 |
| PHK | 89±4 | 72±5 | 86±1 | 85±5 | 102±3 | 87±3 | 84±7 |
| CHK1 | 84±8 | 86±2 | 99±2 | 99±9 | 99±4 | 84±5 | 94±5 |
| CHK2 | 92±5 | 64±1 | 76±4 | 100±0 | 92±3 | 122±1 | 117±5 |
| GSK3β | 88±5 | 75±4 | 74±6 | 87±0 | 108±1 | 88±4 | 100±9 |
| CDK2-Cyclin A | 113±8 | 62±4 | 83±4 | 86±4 | 103±6 | 101±1 | 100±7 |
| PLK1 | 90±9 | 81±4 | 95±1 | 97±1 | 81±2 | 83±1 | 80±1 |
| Aurora B | 88±300 | 78±0 | 75±3 | 81±2 | 106±3 | 90±8 | 90±4 |
| Aurora C | 81±4 | 95±3 | 94±3 | 83±1 | 87±3 | 91±6 | 99±8 |
| AMPK | 98±0 | 29±5 | 71±2 | 72±1 | 112±13 | 110±1 | 106±1 |
| MARK3 | 82±4 | 78±5 | 88±5 | 83±3 | 128±4 | 131±9 | 110±5 |
| BRSK2 | 90±5 | 42±1 | 88±4 | 83±3 | 101±1 | 98±4 | 103±1 |
| MELK | 83±1 | 63±4 | 75±8 | 80±2 | 82±3 | 77±0 | 95±0 |
| CK1δ | 4±0 | 12±1 | 9±2 | 60±4 | 99±6 | 94±9 | 65±5 |
| CK2 | 83±5 | 65±1 | 97±2 | 68±5 | 85±8 | 91±1 | 87±1 |
| DYRK1A | 86±7 | 39±6 | 73±1 | 4±2 | 44±4 | 67±6 | 29±4 |
| DYRK2 | 93±3 | 76±3 | 99±6 | 15±0 | 83±5 | 86±4 | 73±1 |
| DYRK3 | 76±1 | 46±1 | 89±3 | 6±0 | 72±4 | 71±2 | 49±5 |
| NEK2a | 89±7 | 85±4 | 75±6 | 94±1 | 79±0 | 82±4 | 96±5 |
| NEK6 | 79±1 | 90±2 | 95±5 | 87±1 | 90±1 | 93±1 | 94±1 |
| NEK7 | 100±6 | 102±3 | 103±4 | 108±1 | 105±1 | 109±8 | 107±9 |
| IKKβ | 63±3 | 87±2 | 90±5 | 73±9 | 76±8 | 74±1 | 94±5 |
| PIM1 | 93±8 | 28±2 | 43±1 | 86±1 | 94±1 | 92±1 | 104±7 |
| PIM2 | 90±4 | 55±6 | 75±1 | 88±7 | 85±1 | 101±1 | 117±1 |
| PIM3 | 82±4 | 28±1 | 41±1 | 64±1 | 80±4 | 71±1 | 90±6 |
| SRPK1 | 84±5 | 86±2 | 95±1 | 86±7 | 81±3 | 88±8 | 89±6 |
| MST2 | 96±2 | 91±0 | 70±1 | 85±7 | 81±1 | 90±3 | 101±1 |
| EF2K | 100±1 | 94±6 | 100±4 | 104±8 | 101±3 | 102±6 | 107±2 |
| HIPK2 | 80±4 | 98±7 | 96±6 | 108±7 | 104±5 | 101±1 | 91±1 |
| HIPK3 | 96±3 | 86±7 | 95±3 | 87±8 | 104±0 | 93±8 | 97±1 |
| PAK4 | 105±1 | 88±3 | 84±2 | 96±3 | 103±5 | 105±6 | 90±1 |
| PAK5 | 100±1 | 86±7 | 84±1 | 92±5 | 97±8 | 95±4 | 84±7 |
| PAK6 | 103±5 | 78±3 | 76±0 | 83±5 | 105±3 | 92±1 | 106±2 |
| Src | 82±0 | 92±1 | 70±4 | 88±9 | 83±2 | 85±5 | 94±6 |
| Lck | 82±5 | 83±6 | 49±4 | 81±2 | 93±1 | 93±1 | 81±1 |
| CSK | 81±6 | 79±5 | 81±4 | 86±3 | 81±5 | 84±7 | 82±7 |