TABLE 1.
Phosphorylated primer sequences used to construct SIV capsid mutants
| CA mutant | Forward sequencea (5′-3′) |
|---|---|
| Wild type | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| C46A | TGTCAGAAGGTGCCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| T47A | TGTCAGAAGGTTGCGCCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| P48A | TGTCAGAAGGTTGCACCGCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| Y49A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCGCCGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| D50A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGCCATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| I51A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACGCCAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| N52A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTGCCCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| Q53A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATGCCATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| M54A | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGGCCTTAAATTGTGTGGGAG |
| Y49Q | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCCAGGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| I51L | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACCTTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
| Q53T | TGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATACGATGTTAAATTGTGTGGGAG |
a
Sequence for nt 1582 to 1635. Bold type indicates the p11C, C-M epitope; underlining indicates mutated codons.